ABACUS 无轨道密度泛函理论方法使用教程

作者:孙亮,邮箱:l.sun@pku.edu.cn

审核:陈默涵,邮箱:mohanchen@pku.edu.cn

最后更新时间:2023/07/19

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一、无轨道密度泛函理论背景知识

无轨道密度泛函理论(Orbital free density functional theory, OFDFT)是一种第一性原理模拟方法,相比于 Kohn Sham DFT (KSDFT),它的优势之一在于的算法复杂度,这使得 OFDFT 可以用于上万原子甚至更大体系的电子基态计算,或者大体系、长时间的第一性原理分子动力学等。

目前,OFDFT 已被应用于简单金属、合金、半导体、小分子、温稠密物质等体系。

1. 无轨道密度泛函理论

在 OFDFT 的框架下,体系的总能量泛函可以写为

依次为无相互作用动能,电子-离子相互作用能,电子-电子相互作用能,交换关联能,离子-离子相互作用能,其中为电荷密度。

为了在粒子数守恒的条件下求解其极小值,利用拉格朗日乘子法,定义

可以证明,这里的乘子就是无相互作用体系中最高占据态的能量,即化学势。为了保证密度处处为正,一般对进行优化,因此求的导数,为了方便,定义,则有

其中为势能。这就是 OFDFT 求解的方程,一般用共轭梯度(CG)法、截断牛顿(TN)法或 L-BFGS 等优化算法求解。目前 ABACUS 中实现了 TN 法和两种 CG 法(Polak-Ribire 形式和 Hager-Zhang 形式),默认采用 TN 法。

ABACUS 基于平面波基矢量,实现了上述流程,可以进行基于 OFDFT 的自洽计算,分子动力学计算,以及结构弛豫。

2. 动能泛函

OFDFT 的精度高度依赖于动能泛函(kinetic energy density functional, 简称 KEDF)的精度,目前 ABACUS 中实现了 Thomas-Fermi (TF) [1], von Weizsäcker (vW) [2], TFλvW [3], Wang-Teter (WT) [4], Luo-Karasiev-Trickey (LKT) [5]共五种动能泛函。

下面我们对这些泛函做简单介绍,并且介绍在 ABACUS 的 INPUT 文件中如何设置相关的参数。

2.1 Thomas-Fermi KEDF

设置 INPUT 文件中的 of_kinetic tf 参数

对均匀电子气精确成立,可用于极高温体系,比如处于温稠密状态的金属。

可通过 of_tf_weight 调整其权重,默认为 1。

2.2 von Weizsäcker KEDF

设置 of_kinetic vw

对单电子、双电子体系(只有一条轨道)严格成立,一般不单独使用。

可通过 of_vw_weight 调整其权重,默认为 1。

2.3 TFλvW KEDF

设置 of_kinetic tf+

时就是TF KEDF的二阶梯度展开,一般时表现最好。

参数可通过of_vw_weight设置,默认为1。

2.4 Wang-Teter KEDF

设置of_kinetic wt

基于 Lindhard 响应函数推导,在简单金属 Li、Mg、Al 中有着不错的表现。是 ABACUS 默认采用的 KEDF。

参数可通过 of_wt_alphaof_wt_beta 设置,默认值均为

2.5 Luo-Karasiev-Trickey KEDF

设置 of_kinetic lkt

可用于简单金属和半导体,计算效率较高,但在简单金属中精度低于 WT KEDF。

参数 可通过 of_lkt_a 设置,默认值为 1.3。

3. 局域赝势

由于 OFDFT 中舍弃了单电子轨道,无法采用常用的非局域赝势,如模守恒赝势,而必须采用局域赝势。

目前 ABACUS 支持 BLPS (bulk-derived local pseudopotential)。

下载地址: https://github.com/EACcodes/local-pseudopotentials
实空间赝势:ABINIT, ABACUS; 倒空间赝势:PROFESS。
赝势生成(需要和 ABINIT 7.0.5 结合):https://github.com/EACcodes/BLPSGenerator
覆盖 Li, Mg, Al, Si, P, Ga, As, In, Sb 九种元素

使用 BLPS 时,需要在 ABACUS 里调整的参数有:

INPUT 中:pseudo_rcut 16

STRU 中:赝势种类设置为 blps,比如 Al 26.98 al.lda.lps blps

二、ABACUS 中进行 OFDFT 计算的具体流程

1. 自洽计算

1.1 示例

下面是输入文件的示例:

INPUT 文件记录 OFDFT 计算所需主要参数

INPUT_PARAMETERS
#Parameters (1.General)
suffix      example
calculation scf
esolver_type    ofdft

symmetry    1   
pseudo_dir  ../../PP_ORB/
pseudo_rcut 16
nspin        1

#Parameters (2.Iteration)
ecutwfc     60
scf_nmax    50

#Parameters (3.Basis)
basis_type  pw

#OFDFT
of_kinetic  wt
of_method   tn

STRU 文件记录元素种类、质量、赝势,晶格矢量,原子坐标等信息

ATOMIC_SPECIES
Al 26.98 al.lda.lps blps

LATTICE_CONSTANT
7.50241114482312  // add lattice constant

LATTICE_VECTORS
0.000000000000    0.500000000000    0.500000000000    
0.500000000000    0.000000000000    0.500000000000    
0.500000000000    0.500000000000    0.000000000000    

ATOMIC_POSITIONS
Direct

Al
0
1
    0.000000000000    0.000000000000    0.000000000000 1 1 1

KPT 文件(因为 OFDFT 没有电子波函数,所以不需要布里渊区的多个 k 点,Gamma 点就可以)

K_POINTS
0
Gamma
1 1 1 0 0 0

如上所示,与 KSDFT 的自洽计算相比,OFDFT 自洽计算的输入文件有以下几个区别:

  • INPUT
    • 不需要设置 smearing 和 charge mixing 相关参数,如果设置了也没有关系,这些参数不会影响 OFDFT 计算;
    • esolver_type 设置为 ofdft
    • pseudo_rcut 设置为 16,以适配 BLPS 赝势。
  • STRU
    • 将赝势种类设置为 blps

做完以上调整后,即可使用默认参数进行 OFDFT 的自洽计算。

下面列举一些其它的重要参数:

  • of_kinetic:用于选择动能泛函,可选项有 tf, vw, tf+, wt, lkt,默认值为 wt,具体介绍见 1.2 节;
  • of_method:用于选择优化方法,可选项有 tn, cg1, cg2,分别对应截断牛顿法和两种 CG 法(Polak-Ribire 形式和 Hager-Zhang 形式),默认为 tn。一般而言,效率上 tn > cg2 > cg1
  • of_full_pw:做快速傅里叶变换(FFT)时,是否使用全部的平面波,默认为 True。建议打开,可以保证计算的稳定性和精度;
  • of_full_pw_dim:控制 FFT 维数的奇偶性,可选项有 0, 1, 2,分别表示可奇可偶,保证为奇数,保证为偶数,默认为 0。FFT 维数为偶数时,可能导致微小的误差,但一般来说可以忽略。需要注意的是,如果打开了 nbspline,则需要设置 of_full_pw_dim 1,否则会导致计算不稳定。

1.2 注意事项

目前 ABACUS 的 OFDFT 模块并不是十分完善,使用时请注意以下几个注意事项:

  • 目前 OFDFT 不支持 gamma only,因此使用 OFDFT 功能时请关闭 gamma_only
  • 目前 OFDFT 只支持自旋简并,即 nspin 1 的计算;
  • 如果使用 PBE 泛函,建议用 dft_functional XC_GGA_X_PBE+XC_GGA_C_PBE 调用 Libxc 中的 PBE,否则可能导致计算不稳定。

2. 分子动力学与结构弛豫

ABACUS 中支持使用 OFDFT 作为能量、力和应力的求解器,进行分子动力学模拟与结构弛豫。

与使用 KSDFT 进行分子动力学或结构弛豫相比,使用 OFDFT 时,不需要对 MD,relax,或 cell-relax 相关参数进行修改,只需要按照 2.1 中的方式,将能量、力和应力的求解器替换为 OFDFT

下面是几个实际的 INPUT 例子:

2.1 分子动力学(MD)

INPUT_PARAMETERS
#Parameters (1.General)
suffix          test
calculation     md
esolver_type    ofdft
pseudo_dir      ../../PP_ORB
pseudo_rcut     16

#Parameters (2.Iteration)
ecutwfc     60
scf_nmax    100

#OFDFT
of_kinetic  wt
of_method   tn
of_full_pw_dim   1

#Parameters (3.Basis)
basis_type  pw

md_restart  0
md_type     nvt
md_nstep    2
md_dt       0.25
md_tfirst   58022.52706
md_dumpfreq 10
md_tfreq    1.08
md_tchain   1
nbspline    10

2.2 原子结构弛豫(relax)

INPUT_PARAMETERS
#Parameters (1.General)
suffix          test
calculation     relax
esolver_type    ofdft
pseudo_dir      ../../PP_ORB
pseudo_rcut     16

#Parameters (2.Iteration)
ecutwfc     60
scf_nmax    100

#OFDFT
of_kinetic  wt
of_method   tn

#Parameters (3.Basis)
basis_type  pw

relax_nmax  50

2.3 晶格弛豫(cell-relax)

INPUT_PARAMETERS
#Parameters (1.General)
suffix          test
calculation     cell-relax
esolver_type    ofdft
pseudo_dir      ../../PP_ORB
pseudo_rcut     16

#Parameters (2.Iteration)
ecutwfc     60
scf_nmax    100

#OFDFT
of_kinetic  wt
of_method   tn

#Parameters (3.Basis)
basis_type  pw

relax_nmax  50

三、参考文献

[1] Fermi E. Statistical method to determine some properties of atoms[J]. Rend. Accad. Naz. Lincei, 1927, 6(602-607): 5.

[2] Weizsäcker C F. Zur theorie der kernmassen[J]. Zeitschrift für Physik, 1935, 96(7-8): 431-458.

[3] Berk A. Lower-bound energy functionals and their application to diatomic systems[J]. Physical Review A, 1983, 28(4): 1908.

[4] Wang L W, Teter M P. Kinetic-energy functional of the electron density[J]. Physical Review B, 1992, 45(23): 13196.

[5] Luo K, Karasiev V V, Trickey S B. A simple generalized gradient approximation for the noninteracting kinetic energy density functional[J]. Physical Review B, 2018, 98(4): 041111.

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